Visi
Visi Gereja Kristus Yesus adalah "GEREJA YANG MULIA DAN MISIONER", yaitu Gereja yang menyatakan kehadiran Kerajaan Allah dan nilai-nilai-Nya di tengah dunia dalam seluruh aspek kehidupan.
Misi
Misi GKY terdiri dari lima unsur misi Allah bagi Gereja di tengah dunia (Missio Ecclesiae), yaitu:
1. Ibadah.
2. Persekutuan.
3. Pembinaan.
4. Pekabaran Injil.
5. Pelayanan Sosial.
Lima Unsur Misi gereja tersebut berjalan di dalam keseimbangan yang dapat digambarkan sebagai "Bintang dengan Lima Sudut", yang melambangkan:
a. Keseimbangan misi gereja sebagai "Gereja yang Misioner".
b. Tujuan akhir misi gereja, yakni "Gereja yang Mulia".
Penjabaran/Deskripsi Misi GKY
1. Misi dalam Ibadah.
Membangun hubungan vertikal (ibadah) antara "orang percaya" dengan Allah di dalam persekutuan yang berdasar karya penebusan Yesus Kristus di Kayu Salib (Ibrani 10:19-25, Yudas 1:20).
2. Misi dalam Persekutuan
Mewujudkan persekutuan anggota jemaat sebagaimana yang berdasarkan karya penebusan Yesus (Yoh 15:1-17; Yoh 17:1-26) serta teladan yang diberikan gereja mula-mula (Kis 2:41-42).
3. Misi dalam Pembinaan.
Membina jemaat dalam segala segi kehidupan untuk bertumbuh didalam segala hal ke arah Kristus yang adalah Kepala, sehingga mampu hadir dan berkarya sesuai dengan dasar Firman Tuhan di tengah pergumulan dunia sesuai dengan konteks jamannya. (Efesus 4:11-15).
4. Misi dalam Pekabaran Injil.
a. Membentuk jemaat misioner (penginjilan menjadi gaya hidup jemaat) untuk mengemban tugas pemberitaan Injil sebagaimana yang telah diamanatkan oleh Tuhan Yesus Kristus (Mat 28:18-20; Mark 16:15-16).
b. Menjangkau jiwa-jiwa bagi Kristus khususnya diseluruh propinsi di Indonesia dengan hadir dan menjadi rekan bagi gereja-gereja setempat yang sudah ada.
c. Memberitakan Injil Kerajaan Allah dan nilai-nilainya di tengah masyarakat melalui pelayanan dan kehadiran gereja di tengah masyarakat (menyuarakan suara kenabian).
5. Misi dalam Pelayanan Sosial.
a. Menjadi saluran kasih Tuhan bagi jemaat baik di lingkungan GKY maupun jemaat secara umum (Galatia 6:10) di dalam aspek spiritual, moral maupun material.
b. Menjadi saluran kasih Tuhan bagi masyarakat secara umum (Galatia 6:10) untuk menggenapi misi Allah yang holistik.
